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撑篙竹遗传变异的RAPD分析

邢新婷 ,  傅懋毅 ,  费学谦 ,  姜景民

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文章导航 > 林业科学研究  > 2003 >  16(6): 655-660
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shu
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撑篙竹遗传变异的RAPD分析

  • 1.

    中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江富阳 311400

  • 基金项目:

    国家林业部指南项目"竹类植物遗传多样性研究和遗传连锁图谱的构建"(项目编号190)

  • 中图分类号: S795

RAPD Analysis on Genetic Variation of Bambusa pervariabilis McClure

  • 1.

    Research Institute of Subtropical Forestry,CAF,Fuyang311400,Zhejiang,China

  • CLC number: S795

  • 摘要: 采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对6个群体30丛撑篙竹个体进行了遗传变异的研究。28个随机引物共检测到173个位点,其中85个是多态位点,平均每个引物提供6.18个RAPD信息量,扩增出的DNA片段大小一般在200～2000bp范围之间;用POPGENE1 31版软件进行遗传多样性分析:平均Nei's基因多样性为0.2114,Shannon's信息指数为0 3277,基因分化系数0.1853,表明群体间有一定的分化;各群体平均遗传距离0.0350,表明群体亲缘关系较近;试用UPGMA方法对不同产地的撑篙竹群体作聚类分析,初步可将6个群体聚为3类。
    Abstract: Thirty clumps of six populations of Bambusa pervariabilis were analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers to determine the genetic variations among and within the populations. A total of 173 loci including 85 polymorphic loci were amplified using 28 random primers, with an average of 6.18 fragments each primer. The length of fragments was between 200 bp and 2 000 bp. As analyzed by POPGENE version 1.31, the data from six populations had an average Nei's gene diversity of 0.2114, and Shannon's genetic diversity of 0.3277, coefficient of gene differentiation(Gst) of 0.1853, indicating that there was some differentiation among the populations. The average genetic distance among populations was 0.035 0, indicating that there was close relative relations among populations. The six populations were clustered to three categories by cluster analysis (UPGMA) based on Nei's unbiased genetic distance.
  • [1] 邢新婷 , 傅懋毅 . 麻竹RAPD反应条件的优化. 林业科学研究, 2003, 16(5): 554-559.
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出版历程
  • 收稿日期:  2003-05-12

撑篙竹遗传变异的RAPD分析

  • 1. 中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江富阳 311400
  • 收稿日期: 2003-05-12
基金项目:  国家林业部指南项目"竹类植物遗传多样性研究和遗传连锁图谱的构建"(项目编号190)

摘要: 采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对6个群体30丛撑篙竹个体进行了遗传变异的研究。28个随机引物共检测到173个位点,其中85个是多态位点,平均每个引物提供6.18个RAPD信息量,扩增出的DNA片段大小一般在200～2000bp范围之间;用POPGENE1 31版软件进行遗传多样性分析:平均Nei's基因多样性为0.2114,Shannon's信息指数为0 3277,基因分化系数0.1853,表明群体间有一定的分化;各群体平均遗传距离0.0350,表明群体亲缘关系较近;试用UPGMA方法对不同产地的撑篙竹群体作聚类分析,初步可将6个群体聚为3类。

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