• 中国中文核心期刊
  • 中国科学引文数据库(CSCD)核心库来源期刊
  • 中国科技论文统计源期刊(CJCR)
  • 第二届国家期刊奖提名奖

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

版纳龙竹CONSTANS同源基因的克隆与序列分析

崔丽莉 杨汉奇 杨宇明

引用本文:
Citation:

版纳龙竹CONSTANS同源基因的克隆与序列分析

  • 基金项目:

    中国林业科学研究院资源昆虫研究所中央级科研单位基本科研业务费专项(Riri200702M),国家林业局948项目(2008-4-30),国家林业科技支撑项目(2006BAD19B0301),云南省科技厅联合支持国家科技项目(2007GA014)和云南竹藤科学创新团队项目

Cloning and Sequence Analysis of CONSTANS Homologous Gene from Dendrocalamus xishuangbannaensis

  • 摘要: 以版纳龙竹基因组DNA为模板,采用前人基于水稻CO同源基因Hd1序列的保守区所设计的特异引物COS1和COA1,运用PCR方法扩增出一条1 520 bp的DNA片段,并克隆到pGEM-T载体。测序和序列分析结果显示:该片段含有1个590 bp的内含子,编码区930 bp共编码310个氨基酸;该基因被命名为DxCO1,其DNA序列在GenBank中的注册号为GQ358925。在GenBank中进行同源性检索的结果显示:其核苷酸序列与其它禾本科植物CO同源基因的氨基酸序列同源性高达81% - 91%;推测的DxCO1蛋白质序列与其它种子植物CO同源基因蛋白质序列的系统发育分析结果显示:DxCO1与小麦Hd1-like等5个基因聚成了一个强烈支持的分支;另外,在该片段推测的蛋白质序列的氨基端含有一个类似锌指蛋白的B-box(Cx2Cx8Cx7Cx2Cx4Hx8H)结构域,羧基端含有一个CCT(CO, CO-like, TOC1)结构域。序列和结构的高度同源性表明:DxCO1是版纳龙竹的1个CO-like基因,可能对其开花调控有着重要作用。
  • [1]

    Simpson G G, Dean C. Arabidopsis, the rosetta stone of flowering time [J]. Science, 2002, 296: 285-289
    [2]

    Mouradov A C F, Coupland G. Control of flowering time: interacting pathways as a basis for diversity [J]. Plant Cell, 2002, Suppl: 111-130
    [3]

    Datta S, Hettiarachchi G H C M, Deng X W, et al. Arabidopsis CONSTANS-LIKE3 is a positive regulator of red light signaling and root growth [J]. Plant Cell, 2006, 18 (1), 70-84
    [4]

    Miller T A, Muslin E H, Dorweiler J E. A maize CONSTANS-like gene, conz1, exhibits distinct diurnal expression patterns in varied photoperiods [J]. Planta, 2008, 227 (6): 1377-1388
    [5]

    Takahashi Y, Teshima K M, Yokoi S, et al. Variations in Hd1 proteins, Hd3a promoters, and Ehd1 expression levels contribute to diversity of flowering time in cultivated rice [J]. Proc Nation Acad Sci, 2009, 106 (11): 4555-4560
    [6]

    Putterill J, Robson F, Lee K, et al. The CONSTANS gene of Arabidopsis promotes flowering and encodes a protein showing similarities to zinc finger transcription factors [J]. Cell, 1995, 80 (6): 847-857
    [7]

    Suarez-Lopez P, Wheatley K, Robson F, et al. CONSTANS mediates between the circadian clock and the control of flowering in Arabidopsis[J]. Nature, 2001, 410: 1116-1120
    [8]

    Nemoto Y, Kisaka M, Fuse T, et al. Characterization and functional analysis of three wheat genes with homology to the CONSTANS flowering time gene in transgenic rice [J]. Plant J, 2003, 36 (1): 82-93
    [9]

    Holefors A, OPseth L, Rosnes A K R, et al. Identification of PaCOL1 and PaCO2, two CONSTANS-like genes showing decreased transcript levels preceding short day induced growth cessation in Norway spruce [J]. Plant Physiol Biochem, 2009, 47 (2): 105-115
    [10]

    Almada R, Cabrera N, Casaretto J A, et al. VvCO and VvCOL1, two CONSTANS homologous genes, are regulated during flower induction and dormancy in grapevine buds [J]. Plant Cell Rep, 2009, 28 (8): 1193-1203
    [11]

    Hassidim M, Harir Y, Yakir E, et al. Over-expression of CONSTANS-LIKE5 can induce flowering in short-day grown Arabidopsis [J]. Planta, 2009, 230 (3): 481-491
    [12]

    Kim S Y, Yu X H, Michaels S D. Regulation of CONSTANS and FLOWERING LOCUS T expression in response to changing light quality [J]. Plant Physiology, 2008, 148 (1): 269-279
    [13] 辉朝茂, 杨宇明, 杜 凡, 等. 云南竹亚科珍稀种质资源及其开花结实研究[J]. 世界竹藤通讯, 2007, 5(2):15-20

    [14] 杜 凡,薛嘉榕,杨宇明,等.15年来云南竹子的开花现象及其类型的研究[J].林业科学, 2000, 36(6) : 57-68

    [15] 田 波.竹类植物开花时间相关基因的克隆与功能分析 . 昆明: 中国科学院昆明植物研究所, 2005

    [16] 王 泾.云南竹类开花规律研究及人工促进竹子开花的试验 .昆明: 西南林学院资源学院, 2005

    [17] 田 波, 陈永燕, 严远鑫, 等.一个竹类植物MADS区基因的克隆及其在拟南芥中的表达[J].科学通报, 2005, 50(2): 145-151

    [18]

    Mao W, Yang H Q, Li D Z. Dendrocalamus xishuangbannaensis (Poaceae:Bambusoideae), a new species from Yunnan, China [J]. Ann Bot Fennici, 2009, 46 (6): 574-576
    [19]

    Doyle J J, Doyle J L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf material [J]. Phytochem Bull, 1987, 19 (1): 11-15
    [20]

    Felsenstein, J. PHYLIP-Phylogeny Inference Package [J]. Cladistics, 1989, 5 (2): 164-166
    [21]

    Torok M, Elkin L D. Two B or not two B? Overview of the rapidly expanding B-box family of proteins [J]. Differentiation, 2000, 67 (1): 63-71
    [22]

    Strayer C, Oyama T, Schultz T F, et al. Cloning of the Arabidopsis clock gene TOC1, an autoregulatory response regulator homolog [J]. Science, 2000, 289: 768-771
    [23]

    Robson F, Costa M, Hepworth S R, et al. Functional importance of conserved domains in the flowering-time gene CONSTANS demonstrated by analysis of mutant alleles and transgenic plants [J]. Plant J, 2001, 28 (6): 619-631
    [24]

    Komeda Y. Genetic regulation of time to flower in Arabidopsis thaliana [J]. Annu Rev Plant Biol, 2004, 55:521-535
  • [1] 陈鸿鹏朱凤云吴志华谢耀坚 . 赤桉GAPDH家族基因的克隆及其序列分析. 林业科学研究, 2014, 27(1): 120-127.
    [2] 肖政李纪元范正琪殷恒福 . 荔波连蕊茶肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及其表达分析. 林业科学研究, 2014, 27(3): 374-380.
    [3] 黄国文管天球赵雨云陈莫林刘宏辉 . 油茶转录因子基因CoSOC1-like的克隆和表达分析. 林业科学研究, 2022, 35(2): 129-139. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.02.015
    [4] 宋月芹白小军陈庆霄吕琪卉孙会忠 . 红脊长蝽感觉神经元膜蛋白基因克隆及组织表达谱分析. 林业科学研究, 2021, 34(5): 135-141. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.005.016
    [5] 赵天田王贵禧梁丽松马庆华陈新 . 平榛ChWRKY2转录因子的克隆及在低温胁迫下的表达分析. 林业科学研究, 2012, 25(2): 144-149.
    [6] 刘攀峰杜红岩乌云塔娜杜兰英孙志强 . 杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析. 林业科学研究, 2013, 26(4): 447-453.
    [7] 程水源杜何为许锋陈昆松 . 银杏苯丙氨酸解氨酶基因的克隆和序列分析. 林业科学研究, 2005, 18(5): 573-577.
    [8] 刘攀峰杜红岩乌云塔娜黄海燕朱高浦 . 杜仲1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因cDNA全长克隆与序列分析. 林业科学研究, 2012, 25(2): 195-200.
    [9] 万友名马宏刘雄芳张序安静刘秀贤李正红 . 馥郁滇丁香LgFKF1基因的克隆及节律表达分析. 林业科学研究, 2020, 33(1): 99-106. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2020.01.013
    [10] 肖政李纪元范正琪李辛雷殷恒福 . 荔波连蕊茶GA2ox1基因的克隆及表达分析. 林业科学研究, 2016, 29(1): 41-47.
    [11] 赵天田梁丽松马庆华王贵禧 . 平榛ChWRKY28基因克隆及表达模式分析. 林业科学研究, 2016, 29(2): 250-255.
    [12] . 毛竹苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及组织特异性表达分析. 林业科学研究, 2009, 22(3): -.
    [13] . 中国水仙ZDS基因的克隆及表达分析. 林业科学研究, 2009, 22(1): -.
    [14] 孙迎坤李纪元殷恒福范正琪周兴文 . 重瓣山茶花器官发育相关基因CjAPL1的全长克隆与表达分析. 林业科学研究, 2013, 26(4): 473-479.
    [15] 范正琪李纪元田 敏李辛雷陈东亮卢孟柱 . 麻疯树磷酸烯酮式丙酮酸羧化酶em>pepc基因全长cDNA克隆及序列分析. 林业科学研究, 2010, 23(3): 349-354.
    [16] 李雪平高志民彭镇华岳永德高健蔡春菊牟少华 . 绿竹咖啡酸-O-甲基转移酶基因(COMT)的克隆及相关分析. 林业科学研究, 2007, 20(5): 722-725.
    [17] 周兴文李纪元范正琪 . 金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究. 林业科学研究, 2012, 25(1): 93-99.
    [18] 孙涛王雪庆赵遵岭于淑慧陈晓鸣刘魏魏亓倩杨璞 . 白蜡虫热激蛋白序列分析. 林业科学研究, 2016, 29(5): 778-783.
    [19] 翟立峰张美鑫赵行邓佳成 . 重庆樟树溃疡病病原菌的鉴定及序列分析. 林业科学研究, 2019, 32(3): 18-25. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.03.003
    [20] 冯锦霞王敏杰闫伟 . 乳牛肝菌属分离株分子鉴定及其遗传关系的研究. 林业科学研究, 2008, 21(6): 825-831.
  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  3398
  • HTML全文浏览量:  192
  • PDF下载量:  1911
  • 被引次数: 0
出版历程

版纳龙竹CONSTANS同源基因的克隆与序列分析

  • 1. 西南林学院保护生物学学院,云南 昆明 650224
  • 2. 中国林业科学研究院资源昆虫研究所,云南 昆明 650224
基金项目:  中国林业科学研究院资源昆虫研究所中央级科研单位基本科研业务费专项(Riri200702M),国家林业局948项目(2008-4-30),国家林业科技支撑项目(2006BAD19B0301),云南省科技厅联合支持国家科技项目(2007GA014)和云南竹藤科学创新团队项目

摘要: 以版纳龙竹基因组DNA为模板,采用前人基于水稻CO同源基因Hd1序列的保守区所设计的特异引物COS1和COA1,运用PCR方法扩增出一条1 520 bp的DNA片段,并克隆到pGEM-T载体。测序和序列分析结果显示:该片段含有1个590 bp的内含子,编码区930 bp共编码310个氨基酸;该基因被命名为DxCO1,其DNA序列在GenBank中的注册号为GQ358925。在GenBank中进行同源性检索的结果显示:其核苷酸序列与其它禾本科植物CO同源基因的氨基酸序列同源性高达81% - 91%;推测的DxCO1蛋白质序列与其它种子植物CO同源基因蛋白质序列的系统发育分析结果显示:DxCO1与小麦Hd1-like等5个基因聚成了一个强烈支持的分支;另外,在该片段推测的蛋白质序列的氨基端含有一个类似锌指蛋白的B-box(Cx2Cx8Cx7Cx2Cx4Hx8H)结构域,羧基端含有一个CCT(CO, CO-like, TOC1)结构域。序列和结构的高度同源性表明:DxCO1是版纳龙竹的1个CO-like基因,可能对其开花调控有着重要作用。

English Abstract

参考文献 (24)

目录

    /

    返回文章
    返回