油桐尺蛾核型多角体病毒lef-8基因结构及系统进化分析

罗辑; 周国英; 朱积余

油桐尺蛾核型多角体病毒lef-8基因结构及系统进化分析

1.
中南林业科技大学林学院, 湖南长沙 410004
2.
广西壮族自治区林业科学研究院, 广西南宁 530002
基金项目:
中国博士后科学基金资助项目(2014M552533XB);广西林科院博士后专项资金项目(林科2013号);广西林科院基金项目(林科201401号)
中图分类号: S763.3

The Structural and Phylogenetic Analysis of Late Expression Factor 8

1.
College of Forestry, Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, Hu'nan, China
2.
2.Guangxi Zhuang Autonomous Region Forestry Research Institute, Nanning 530002, Guangxi, China
CLC number: S763.3

摘要: lef-8 基因作为杆状病毒重要的早期表达基因,编码病毒RNA聚合酶的最大亚基。本文通过对油桐尺蛾核型多角体病毒lef-8 基因进行测序,对其基因结构及其在杆状病毒中的系统进化进行了分析。发现lef-8 基因在油桐尺蛾核型多角体病毒中编码区长2 634 bp,编码877个氨基酸。在5'-UTR区具有可能为其启动子及转录起始位点的信号序列,在3'-UTR区具有加尾信号序列,但这些序列的具体功能还有待进一步研究。其蛋白序列与常见的模式NPV同源性较低,但具有共同的签名序列。通过对杆状病毒lef-8 基因的系统进化分析,发现颗粒体病毒和核型多角体病毒明显分为两支,而核型多角体病毒中又明显分为4个分支,其进化关系在很大程度上与其寄主的进化关系相关。
- 油桐尺蛾
- / 核型多角体病毒
- / 杆状病毒
- / lef-8 基因
- / 基因结构
- / 系统进化
Abstract: Late expression factor 8 (lef-8) gene is an early expression gene, and codes the largest subunit of RNA polymerase in baculovirus. The authors sequenced the lef-8 gene of Buzura suppressaria nuclear polyhedrosis virus (BsNPV). It had 2 634 bp coding region and encoding 877 amino acid residues. Some signal sequences were found in untranslated region (UTR): possible promoter and transcription initiation site were found in 5'-UTR, and a putative polyadenylation signal sequence was found in 3'-UTR. But whether they had substantial function needs further research. The protein sequence of lef-8 gene in BsNPV was low homologous to model NPVs. But they had nearly the same signal sequence. By phylogenetic analysis of lef-8 gene in baculovirus, it was found that the nuclear polyhedrosis virus (NPV) and the granulosis virus (GV) was separated obviously to two branches, while the NPV broke into 4 branches. And evolutionary relationship in baculovirus was largely associated with its host.
- Buzura suppressaria
- / nuclear polyhedrosis virus
- / baculovirus
- / lef-8 gene
- / gene structure
- / phylogenetic analysis

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