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毛竹TIPs基因家族成员组织表达模式研究

孙化雨 娄永峰 李利超 赵韩生 高志民

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毛竹TIPs基因家族成员组织表达模式研究

  • 基金项目:

    国家科技支撑计划课题“竹藤优异种质创制创新与种苗培育标准化示范”(2015BAD04B01)、国际竹藤中心基本科研业务费专项资金项目(1632015008)。

  • 中图分类号: S795.7

Tissue Expression Pattern Analysis of TIPs Genes in Phyllostachys edulis

  • CLC number: S795.7

  • 摘要: [目的] 通过研究毛竹TIPs的分子特征和表达模式,为揭示逆境胁迫条件下TIPs在竹子中的作用提供证据,为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法] 以毛竹为对象,利用生物信息学方法对毛竹基因组中的TIPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和NaCl胁迫下的表达模式。[结果] 毛竹基因组中含有6个TIPs同源基因,分别隶属于3个亚类(TIP1、TIP2和TIP4)。基因结构预测显示,PeTIP1;1、PeTIP1;2、PeTIP2;2和PeTIP4;2由2个外显子和1个内含子组成,而PeTIP2;1和PeTIP4;1由3个外显子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示,毛竹6个TIPs均具有2个典型的NPA结构域和4个ar/R模体。通过转录组数据分析基因的组织表达特异性,结果表明PeTIP1;1在各组织中的表达丰度均较高;PeTIP1;2主要在花中表达;PeTIP2;1在根和鞭中表达量较高;PeTIP2;2在根中特异表达;PeTIP4;1在叶片中表达丰度最高;PeTIP4;2在笋和鞭中表达水平较高,在根中最低。实时定量PCR结果分析证明,干旱处理后毛竹根中PeTIP4;1的表达量显著升高(pPeTIP2;1、PeTIP2;2和PeTIP4;2表达受到抑制(pPeTIP1;1和PeTIP4;1表达量显著增加(pPeTIP1;2、PeTIP2;2、和PeTIP4;2则显著降低(pPeTIPs的表达量均显著增加(pPeTIP1;1、PeTIP1;2和PeTIP4;1表达量均显著增加(ppPeTIP2;1表达受到明显抑制(p[结论] PeTIPs可能在毛竹抵抗干旱、水淹和NaCl等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-08-04

毛竹TIPs基因家族成员组织表达模式研究

  • 1. 国际竹藤中心, 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室, 北京 100102
基金项目:  国家科技支撑计划课题“竹藤优异种质创制创新与种苗培育标准化示范”(2015BAD04B01)、国际竹藤中心基本科研业务费专项资金项目(1632015008)。

摘要: [目的] 通过研究毛竹TIPs的分子特征和表达模式,为揭示逆境胁迫条件下TIPs在竹子中的作用提供证据,为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法] 以毛竹为对象,利用生物信息学方法对毛竹基因组中的TIPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和NaCl胁迫下的表达模式。[结果] 毛竹基因组中含有6个TIPs同源基因,分别隶属于3个亚类(TIP1、TIP2和TIP4)。基因结构预测显示,PeTIP1;1、PeTIP1;2、PeTIP2;2和PeTIP4;2由2个外显子和1个内含子组成,而PeTIP2;1和PeTIP4;1由3个外显子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示,毛竹6个TIPs均具有2个典型的NPA结构域和4个ar/R模体。通过转录组数据分析基因的组织表达特异性,结果表明PeTIP1;1在各组织中的表达丰度均较高;PeTIP1;2主要在花中表达;PeTIP2;1在根和鞭中表达量较高;PeTIP2;2在根中特异表达;PeTIP4;1在叶片中表达丰度最高;PeTIP4;2在笋和鞭中表达水平较高,在根中最低。实时定量PCR结果分析证明,干旱处理后毛竹根中PeTIP4;1的表达量显著升高(pPeTIP2;1、PeTIP2;2和PeTIP4;2表达受到抑制(pPeTIP1;1和PeTIP4;1表达量显著增加(pPeTIP1;2、PeTIP2;2、和PeTIP4;2则显著降低(pPeTIPs的表达量均显著增加(pPeTIP1;1、PeTIP1;2和PeTIP4;1表达量均显著增加(ppPeTIP2;1表达受到明显抑制(p[结论] PeTIPs可能在毛竹抵抗干旱、水淹和NaCl等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。

English Abstract

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