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微管(Microtubule)是由α-微管蛋白(α-tubulin,TUA)和β-微管蛋白(β-tubulin,TUB)以异二聚体的形式聚合成的中空管状结构,它与微丝(Microfilament)和中间纤维(Intermediate filament)共同组成了细胞骨架。微管蛋白是高度保守的,植物、动物、原生生物和真菌中的TUA和TUB蛋白具有高达88%的序列相似性[1-2]。迄今为止,人们已在拟南芥中发现6个TUA蛋白和9个TUB蛋白[3];在水稻中发现4个TUA蛋白[4]和8个TUB蛋白[5];在毛果杨中有8个TUA蛋白和20个TUB蛋白[6]。
微管对植物生长发育有着重要作用,研究表明,微管影响细胞形态发生,并最终影响植物的形态。Abe等[7]发现,拟南芥中TUA6和TUA4突变体lefty1和lefty2出现左旋生长的现象,其中,包括lefty1和lefty2双突变体幼苗下胚轴螺旋生长,根伸长区的径向细胞扩增,周质微管排列比野生型更加片段化且不对齐。在双突变体植株中,花丝细胞的各向异性生长受到严重损害。微管和微丝骨架的动态变化还参与了细胞周期进程的调节[8]。在拟南芥中,短期的低温会影响有丝分裂末期的径向微管列阵的形成,从而导致二倍体和多倍体花粉的产生[9]。微管在植物抵御环境胁迫的过程中也发挥重要作用。Wang等[10]发现, 盐胁迫诱导下拟南芥周质微管发生解聚和重组,提出周质微管在植物对盐胁迫的耐受性中发挥重要作用。此外,微管在信息传递[11]、纤维素微纤维沉积和木材形成[6, 12],调节气孔运动[13]等方面具有重要功能。
目前,林木微管蛋白功能的研究鲜有报道,特别是微管调控林木形态与材性分子机制的研究尚属空白。研究微管功能首先要对活体材料进行微管的形态观察,而现在缺乏林木微管研究的转基因材料,因此,建立稳定遗传的林木微管标记的转基因株系是首要且重要的。为此,首先要构建植物微管荧光表达载体,且通过瞬时表达等方法加以验证。构建荧光表达载体时,目的基因连接在荧光标签的N’端还是C’端一直存在争议,在拟南芥中发现,微管蛋白连接在荧光蛋白C’端时会影响转基因植物荧光观察[14]。本研究以84K杨为材料,克隆获得84KTUA5和84KTUB16基因,并通过同源重组的方法分别将84KTUA5和84KTUB16基因连接至荧光标签mCherry的N’端和C’端,共构建了4种重组载体,并通过烟草叶片瞬时表达系统,验证了重组蛋白的表达及其产生的荧光信号,为进一步研究杨树微管功能奠定基础。
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本氏烟草( Nicotiana benthamiana ) 组培苗由本实验室保存。
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大肠杆菌(Escherichia coli)TOP10 感受态细胞购自天根生化科技(北京)有限公司;根癌农杆菌GV3101感受态细胞购自北京华越洋生物科技有限公司;植物表达载体pCAMBIA 1300-mCherry购自淼灵质粒平台;EASYspin 植物 RNA 快速提取试剂盒、cDNA反转录试剂盒、pTOPO-TA- simple克隆试剂盒、琼脂糖凝胶纯化回收试剂盒、质粒小提试剂盒购自北京艾德莱生物科技有限公司;重组酶试剂盒购自南京诺唯赞生物科技有限公司;DL2000 DNA Marker 购自宝生物工程(大连)有限公司;试验过程中所用的限制性内切酶均购自NEB公司;引物的合成和序列的测定均在北京擎科公司完成;卡那霉素、壮观霉素、庆大霉素、利福平购自北京coolaber科技有限公司。
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本研究中用到的拟南芥基因组数据库为http://www.arabidopsis.org/;毛果杨基因组数据库为https://phytozome. jgi.doe.gov/pz/portal.html;核酸和氨基酸序列比对软件为BioEdit。
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根据文献中提供的毛果杨TUA5和TUB16基因编号[6],搜索其基因组数据库,分别获得PtTUA5和PtTUB16基因序列。由于微管蛋白在各物种间的保守性很高,因此,本研究以毛果杨的TUA5和TUB16基因为模板,利用Primer软件设计同源引物,用于克隆84K杨的TUA5和TUB16基因。提取84K杨的RNA并反转录成cDNA,以此为模板进行同源克隆,PCR克隆反应所用引物84KTUA5-UTR和84KTUA16-UTR的序列信息见表1。
引物名称 Primer name 引物序列 Primer sequences (5' to 3') 同源克隆引物 84KTUA5-UTR F: ATAAACGTCTTCGCTCCTATTCTCC
R: TATTAGGCTACACCCATTACGAAGG84KTUA16-UTR F: TAACGCGAAACAAAAAATGAGAGAA
R: TCAAACACGAACACCAATACAAAACCherry N’端同源重组引物 84KTUA5-Cherry F: gcttcgaattctgcagtcgacATGAGAGAGTGCATTTCGATCCAC
R: atcccgggcccgcggtaccgCATGTACTCGTCACCATCATCATCA84KTUB16-Cherry F: gcttcgaattctgcagtcgacATGAGAGAAATCCTTCACGTTCAGG
R: atcccgggcccgcggtaccgCATCCCGGCAGCATCTTCTT连接肽PCR扩增引物 Linker-84KTUA5 F: AGGGAGGTGGAAGTGGAGGTAGCGGTATGAGAGAGTGCATTTCGATCCAC
R: TCACATGTACTCGTCACCATCATCALinker-84KTUB16 F: GGGAGGTGGAAGTGGAGGTAGCGGTATGAGAGAAATCCTTCACGTTCAGG
R: TTACATCCCGGCAGCATCTTCTTCherry C’端同源重组引物 Cherry-84KTUA5 F: ggcggcatggacgagctgtacaAGGGAGGTGGAAGTGGAGGTAG
R: attctagcccctagatcacttgtacaTCACATGTACTCGTCACCATCATCATCherry-84KTUB16 F: ggcggcatggacgagctgtacaAGGGAGGTGGAAGTGGAGGTAG
R: gcattctagcccctagatcacttgtacaTTACATCCCGGCAGCATCTTCT鉴定引物 Gene-Cherry F: acgagctcaagcttcgaattctg
R: caccttgaagcgcatgaactccCherry-Gene F: gactacaccatcgtggaacagtac
R: acgttgtaaaacgacggccagtTable 1. The primers of 84KTUA5 and 84KTUB16
克隆得到的84KTUA5和84KTUB16基因分别与pTOPO-T simple载体连接,连接产物转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,并涂布于含Amp(100 mg·L−1)的LB固体培养基上,37℃倒置培养12 h,挑取单菌落,进行菌落PCR鉴定并测序。测序结果利用BioEdit软件与毛果杨的TUA5和TUB16基因进行序列比对。
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84KTUA5和84KTUB16与荧光蛋白基因mCheery N’端连接植物表达载体构建的具体步骤如下:双酶切(KpnⅠ和SalⅠ)pCAMBIA 1300载体,设计与载体一致的同源重组引物(表1),PCR扩增84KTUA5和84KTUB16基因,利用重组酶clonExperss Mix将扩增得到的目的基因连接在pCAMBIA 1300载体mCherry荧光标签的N’端,获得植物过表达载体pCAMBIA 1300-84KTUA5-mCherry和pCAMBIA 1300-84KTUB16-mCherry,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,涂布于含Kan(50 mg·L−1)的LB固体培养基上,37℃倒置培养12 h,挑取单菌落进行菌落PCR鉴定。鉴定采用的上下游引物序列分别来自于载体和插入基因(表1),筛选阳性克隆并测序。
84KTUA5和84KTUB16与荧光蛋白基因mCheery C’端连接植物表达载体构建的具体步骤如下:由于mCherry荧光标签的C’端存在终止密码子且无过度序列,为了同时保证插入蛋白和荧光蛋白形成正确的构象,84KTUA5和84KTUB16基因需借助连接肽连接在mCherry荧光标签的C’端。连接肽的序列为(5’-GGAGGTGGAAGTGGAGGTAGCGGT-3’),PCR扩增获得linker-84KTUA5和linker-84KTUB16序列,引物见表1。纯化回收后分别与pTOPO-T simple载体连接,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,涂布于含Amp(100 mg·L−1)的LB固体培养基上,37℃倒置培养12 h,挑取单菌落进行菌落PCR鉴定并测序。采用同源重组的方法将上述序列与pCAMBIA 1300载体连接(酶切位点为BsrG I-HF),获得植物过表达载体pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUA5和pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUB16,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,涂布于含Kan(50 mg·L−1)的LB固体培养基上,37℃倒置培养12 h,挑取单菌落进行菌落PCR鉴定,引物见表1,筛选阳性克隆并测序。载体构建过程见图1。
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构建成功的重组质粒通过电击转化法转入农杆菌GV3101中,涂布在含有Rif(50 mg·L−1)、Kan(50 mg·L−1)和Gent(50 mg·L−1)的LB固体培养基上,28℃倒置培养24 h,挑取单菌落进行菌落PCR鉴定并测序。
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含有重组质粒的农杆菌菌液扩大培养至OD600=0.6~0.8,5 000 rpm离心10 min,收集菌体,配制烟草注射液(10 mmol·L−1 MgCl2,10 mmol·L−1 MES,pH 5.6),加入200 μmol·L−1 AS(乙酰丁香酮),悬浮菌体,使OD600约为1.0,室温放置2 h,选取3~4周长势较好的本氏烟草为植物材料,按照Imogen等[15]的瞬时表达方法,用注射器将注射液从叶片下表皮注射到烟草叶片内(图2A)。
农杆菌侵染48 h后的本氏烟草叶片置于滴有蒸馏水的载玻片上,做成临时封片,立即在激光共聚焦显微镜下观察叶片组织的上表皮细胞。本研究中所用的显微镜为Zeiss LSM510倒置激光扫描共聚焦显微镜。所用激光器为594 nm氦氖激光器(2 mW),激发光波长为594 nm,发射光接收范围为630~695 nm。用于图像采集的显微镜物镜为40×物镜,数值孔径为1.44,针孔大小为1 AiryUnit,扫描分辨率为1 024×1 024。采用Zen软件分析实验结果。
1.1. 实验材料
1.2. 载体及主要试剂
1.3. 数据库与分析软件
1.4. 84K杨TUA5和TUB16基因的克隆
1.5. 植物过表达载体的构建
1.6. 农杆菌转化
1.7. 烟草瞬时表达和荧光观察
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从克隆产物菌落PCR鉴定结果(图3)可以看出:在1 300 bp左右有明显条带,与预测的目的基因片段大小吻合,初步确定为目的基因片段。测序结果显示:84KTUA5基因CDS序列全长1 344 bp,编码448个氨基酸;84KTUB16基因CDS序列全长1 356 bp,编码452个氨基酸,利用BioEdit软件对84K杨与毛果杨中的TUA5和TUB16基因序列进行同源比对(表2),其同源性分别达98.80%和96.70%。
Sequences Pt-TUA5 84K-TUA5 Pt-TUB16 84K-TUB16 Pt-TUA5 ID 98.80 50.50 50.30 84K-TUA5 98.80 ID 50.50 50.30 Pt-TUB16 50.50 50.50 ID 96.70 84K-TUB16 50.30 50.30 96.70 ID Table 2. Sequences homology alignment %
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对4种重组表达载体pCAMBIA 1300-84KTUA5-mCherry、pCAMBIA 1300-84KTUB16-mCherry、pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUA5、pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUB16进行菌落PCR鉴定。由图4可以看出:2 200 bp左右有明显条带,与预测序列大小一致。经测序后,用BioEdit软件进行序列分析,结果表明,目的基因已成功插入pCAMBIA 1300-mCherry表达载体中。
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激光共聚焦结果(图2B)显示:pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUA5和pCAMBIA 1300-mCherry-84KTUB16重组质粒转化的烟草叶片上表皮细胞的细胞膜上有红色荧光分布,表明这两种融合蛋白能够正确表达,可以用于后续的遗传转化实验;而pCAMBIA 1300-84KTUA5-mCherry和pCAMBIA 1300-84KTUB16-mCherry重组质粒转化的烟草叶片上表皮细胞无法观察到红色荧光,说明这两种融合蛋白未能正确表达,无法用于后续实验。本实验观察的是叶片上表皮细胞,几乎不含叶绿体,因此,叶绿体自发荧光对观察结果的影响较小,且由于荧光标记的是周质微管,因而,只在细胞边缘发现红色荧光。